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Sequence Alignment Viewer

Allineamento globale di sequenze DNA o proteiche con algoritmo Needleman-Wunsch. Tool client-side: la tua sequenza non lascia il browser.

Sequenze in input

FASTA con header > o DNA/proteina grezzo (A-Z). Max 100 caratteri.

FASTA con header > o DNA/proteina grezzo (A-Z). Max 100 caratteri.

Parametri scoring
Basi uguali
Basi diverse
Inserimento/delezione

Risultato allineamento

Score 17
Identity88%
Gap8%
Lunghezza25
Match22
Gap pos.2

| match. mismatch gap- inserzione/delezione

1
ACGTACGTACGTAAGCTAGCTAGC-
ACGTAGGTACGTAA-CTAGCTAGCT

Per studenti di Bioinformatica

L'algoritmo di Needleman-Wunsch (1970) è il fondamento dell'allineamento globale. Usa la programmazione dinamica per trovare l'allineamento ottimale tra due sequenze intere, minimizzando penalità per gap e mismatch.

Questo tool fa parte della sezione Università e supporta studenti delle magistrali in Bioinformatica di:

  • UniBa — primo corso magistrale Bioinformatica del Sud Italia
  • Tor Vergata — Bioinformatica con 1/3 percorso in laboratorio

Approfondisci la teoria con la serie UniAppunti / Bioinformatica.

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